CHIP

时间:2018-10-30浏览次数:3236

胞内DNA与蛋白质相互作用:CHIP


实验意义

CHIP技术是研究体内DNA与蛋白质相互作用的技术,用于阐明真核生物基因表达机制的基本途径,CHIP可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以研究组蛋白的各种共价修饰和基因表达之间的关系,在基友表达调控研究中发挥着重要的作用。CHIP是表观遗传信息研究的主要方法,是深入分析恶性肿瘤、癌症、心血管疾病以及神经退行性疾病等病理诊断和基础与临床研究的有效工具。


实验原理及流程

染色体免疫沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, CHIP)分析的是细胞内生理状态下DNA结合蛋白与基因组DNA相互作用的技术,也称作结合位点分析法,通常用于转录因子结合位点或者组蛋白特异性修饰位点的研究。基本原理是在活细胞的状态固定DNA-蛋白质复合物,然后通过免疫学的方法沉淀复合物,特异性地富集纯化后,对其进行检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。后续的分析检测可以通过定量PCR、Western Blot、CHIP-Seq、CHIP-chip(微阵列芯片分析)。

流程主要有:甲醇固定细胞→超声破碎→目的蛋白的抗体孵育→加入Protein A,结合抗体-靶蛋白-DNA复合物,沉淀→洗脱后得到富集的靶蛋白-DNA复合物→分离富集的DNA和蛋白质→分析检测。

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结果展示

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实验完成周期及交付标准

实验周期:1-3个月

交付标准:CHIP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、原始数据等

 

实验需与客户确认的信息

1. 目的基因与蛋白信息。

2. 样本类型与种属

3. 是否提供抗体

 

参考文献

[1] Orlando D , Chen M , Brown V , et al. Quantitative ChIP-Seq Normalization Reveals Global Modulation of the Epigenome[J]. Cell Reports, 2014, 9(3):1163-1170.

[2] Kohzaki H , Asano M . Chromosome and genetic testing using ChIP assay[J]. Frontiers in Bioscience, 2016, 8(2):298.

 

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