RAP

时间:2018-10-30浏览次数:3650

实验意义

探究转录后水平RNA与蛋白质的相互作用,以及转录后调控网络的动态变化,可了解恶性肿瘤以及遗传学疾病等转录后调控网络的动态变化,应用于病理诊断和科学研究工作等。


实验原理及流程

RNA反义纯化(RNA Antisense Purification, RAP)设计一段与目标RNA互补的寡核苷酸探针,并对其进行生物素标记,使用该探针将目标RNA拉下来,同时与目标RNA相互作用的蛋白也被捕获,然后经链霉亲和素标记的磁珠纯化,通过Real Time RT-PCR、WB、二代测序或质谱进行进一步的鉴定。实验流程为探针设计→待测样品准备(细胞、组织或待测RNA和蛋白质等)→生物素标记探针与RNA杂交→RAP→分离RNA和蛋白质进行鉴定分析。


结果展示[1]

rap1.png

 

实验周期及交付标准

1. 实验周期:1-3个月

2. 交付标准:RAP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、原始数据等

 

需确认的信息

1. 目的基因及种属以及ID号。

2. 目的基因序列

3. 样本数量及分析要求

 

参考文献

[1] Engreitz J , Sirokman K , Mcdonel P , et al. RNA-RNA Interactions Enable Specific Targeting of Noncoding RNAs to Nascent Pre-mRNAs and Chromatin Sites[J]. Cell, 2014, 159(1):188-199.

[2] Engreitz J , Lander E S , Guttman M . RNA Antisense Purification (RAP) for Mapping RNA Interactions with Chromatin[J]. Methods Mol Biol, 2015, 1262(1262):183-197.


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