RIP

时间:2018-10-30浏览次数:2561

胞内RNA与蛋白质结合情况的验证:RIP


实验意义

研究细胞内RNA与蛋白质的结合情况,有助于了解转录后调控网络的动态过程,发现miRNA的调控靶点,可了解恶性肿瘤以及遗传学疾病等整体水平的RNA变化以及转录后调控网络的变化,应用于病理诊断及科学研究。


实验原理及步骤

RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA Binding Protein Immunoprecipitation, RIP)的基本原理是使用目标蛋白的抗体捕获内源性的RNA-蛋白的复合物,然后通过免疫沉淀的方法把RNA-蛋白复合物一起分离下来,然后通过RT-PCR、RIP-Seq(高通量测序)或RIP-Chip(microarray)来鉴定结合的RNA序列。RIP流程如下图[1]


结果展示

RIP1.png


RIP2.png


实验周期及交付标准

1. 实验周期:1-3个月

2. 交付标准:RIP鉴定结果报告、分析报告、实验报告(试剂、耗材、实验步骤)、原始数据等

 

需确认的信息

1. 目的基因与蛋白信息。

2. 是否提供抗体

3. 样本分组及分析要求

 

参考文献

[1] Gagliardi M, Matarazzo M R. RIP: RNA Immunoprecipitation[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480:73.

[2] Meyer K , K?Ster T , Nolte C , et al. Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7[J]. Genome Biology, 2017, 18(1):204.

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