当前位置:首页 > 技术资源 > 科研干货

Stem Cell Research & Therapy|TGF-β1诱导人肾类器官纤维化,PIM1成为候选干预靶点

时间:2026-06-04 阅读:114
头2.gif

写在前面

慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)进展过程中,肾纤维化是肾组织持续受损后的常见病理变化。细胞外基质(extracellular matrix,ECM)过量沉积,会逐渐破坏肾小球、肾小管和间质结构,最终影响肾脏功能。


1.png

转化生长因子β1(TGF-β1)是研究肾纤维化时常用的诱导因子,但它同时参与多种正常生理过程,但直接阻断效果并不理想。因此,找到TGF-β1下游更具体的纤维化相关分子,更有利于开展机制研究和候选干预因素验证。


2026年4月,Stem Cell Research & Therapy 发表研究论文 “Induction of fibrosis in human kidney organoids delineates mechanisms and therapeutic targets of fibrotic kidney disease”研究团队使用TGF-β1处理人肾类器官,诱导出肾单位结构减少、肌成纤维细胞增加和胶原沉积等纤维化相关改变,并进一步发现PIM1在受损近端小管细胞中升高;使用PIM1抑制剂AZD1208后,类器官中的促纤维化表型减少。



01 研究亮点


1. 构建含肾单位和间质成分的人肾类器官

由hiPSCs诱导形成的类器官中可检测到足细胞、近端小管、远端小管和间质成纤维细胞,并存在少量CD31⁺血管样结构,为后续纤维化建模提供了组织基础。


2. TGF-β1处理诱导多种肾纤维化相关改变

类器官经TGF-β1处理后,α-SMA⁺肌成纤维细胞增加,肾单位上皮结构减少,并出现肾小球硬化样改变、肾小管萎缩伴管周纤维化及胶原沉积增加


3. 转录组分析发现炎症和JAK/STAT信号异常

纤维化类器官中,上皮-间质转化、炎症反应、代谢变化及Janus激酶/信号转导与转录激活因子(JAK/STAT)信号均发生变化


4. 托法替布可减少TGF-β1诱导的纤维化表型

在TGF-β1处理期间加入JAK/STAT抑制剂托法替布(tofacitinib)后,类器官中STAT3表达下降,α-SMA⁺肌成纤维细胞减少


5. PIM1抑制剂AZD1208减少促纤维化改变

PIM1在纤维化类器官受损的近端小管细胞中升高;使用AZD1208抑制PIM1后,α-SMA⁺肌成纤维细胞减少,ACTA2和COL1A1表达下降。 



02 研究内容


1. 人肾类器官形成可用于纤维化建模的肾单位和间质结构

要在类器官中研究肾纤维化,首先需要确认模型中是否存在可观察损伤和间质重塑的肾脏相关结构。研究人员以hiPSCs为起始细胞,通过阶段性加入CHIR99021、Noggin、Activin和FGF9,引导细胞向肾脏谱系分化,并在分化第9天转入三维培养。


培养至第26天,类器官中形成了PODXL⁺足细胞、LTL⁺近端小管和CDH1⁺远端小管。足细胞表达NPHS1、NPHS2和PODXL,NPHS1与NPHS2在细胞连接区域共定位,形成裂孔隔膜样结构。近端和远端小管均出现管腔,LTL阴性小管结构周围可见富含COL1A1的基底膜。


除肾单位上皮结构外,类器官间质部分主要由PDGFRα⁺、α-SMA⁻间质成纤维细胞构成,同时可观察到少量CD31⁺血管样结构。正常条件下,COL1A1主要局限于肾小管周围基底膜区域,并未出现明显的间质广泛沉积。


这些结果说明,该肾类器官同时具备肾单位上皮和间质基础,可用于后续观察纤维化过程中肾小管、足细胞及间质成分的变化。

2.png

图1|由人诱导多能干细胞生成肾类器官

A. hiPSCs向肾类器官分化的流程示意图。B. 第26天成熟肾类器官的明场图像。比例尺,100 μm。C. 第26天肾类器官中足细胞(PODXL)、近端小管(LTL)、远端小管(CDH1)和细胞核(DAPI)的免疫荧光分析。比例尺,100 μm。D. 第26天肾类器官中的足细胞。比例尺,10 μm。E. 肾类器官足细胞中,NPHS1与NPHS2共定位,形成裂孔隔膜样结构。比例尺,2 μm。F. 第26天足细胞相关标志基因的定量PCR分析,基因表达量相对于成纤维细胞。G. 第26天近端小管和远端小管的免疫荧光分析。比例尺,10 μm。H. LTL阴性小管结构形成富含COL1A1的基底膜。比例尺,10 μm。I. 第26天近端和远端小管相关标志基因的定量PCR分析,基因表达量相对于成纤维细胞。J. 肾类器官中的CD31⁺血管样结构。K. 正常肾类器官中,I型胶原(COL1A1)表达局限于肾小管周围基底膜。L. 间质部分由PDGFRα⁺且α-SMA阴性的间质成纤维细胞构成。J、K、L左图比例尺,100 μm;L右图比例尺,10 μm。免疫荧光图像代表至少3个类器官;定量PCR数据为8个合并类器官技术重复的平均值 ± 标准差。


2. TGF-β1使肾类器官出现肾单位减少和间质纤维化改变

在确认类器官具备基础肾组织结构后,研究人员进一步建立体外肾纤维化模型。从分化第21天至第26天,研究人员连续使用10 ng/mL TGF-β1处理肾类器官,并在第26天检测组织结构和相关分子变化。


与未处理类器官相比,TGF-β1处理后的类器官中α-SMA⁺肌成纤维细胞明显增加,而PODXL⁺足细胞和LTL⁺近端小管结构减少。高倍免疫荧光图像中还可观察到肾小球硬化样改变,以及肾小管萎缩伴管周纤维化改变。


定量分析显示,处理组中足细胞、近端小管和远端小管覆盖面积下降,α-SMA⁺肌成纤维细胞覆盖面积增加超过两倍。与此同时,PODXL、NPHS1、NPHS2、WT1、LRP2、CDH1和SLC12A1等肾单位上皮相关基因表达下降;ACTA2、COL1A1和FN1等促纤维化相关基因表达升高。


间质区域中,COL1A1沉积增强,PDGFRα⁺间质成纤维细胞增多。该实验表明,TGF-β1能够在人肾类器官中诱导肾单位结构减少、肌成纤维细胞扩增和细胞外基质沉积等纤维化相关变化。

3.png

图2|肾类器官作为肾纤维化体外疾病模型

A. 在肾类器官中诱导纤维化的分化流程示意图。B. 第26天对肌成纤维细胞(α-SMA)、足细胞(PODXL)、近端小管(LTL)和细胞核(DAPI)进行免疫荧光分析,显示TGF-β1处理后的类器官中肌成纤维细胞扩增。比例尺,100 μm。C. TGF-β1处理后的类器官出现纤维化肾病相关特征,包括肾小球硬化样改变和肾小管萎缩伴管周纤维化。比例尺,10 μm。D. 第26天肾单位节段定量分析显示实质细胞减少。数据为平均值 ± 标准差,n = 4。E. 第26天肌成纤维细胞覆盖面积定量分析。数据为平均值 ± 标准差,n = 4;t检验,p < 0.001。F. 第26天肾单位上皮相关标志基因的定量PCR分析。G. 第26天促纤维化相关标志基因表达升高。H. 肾类器官纤维化伴随间质I型胶原表达增加和PDGFRα⁺间质成纤维细胞增殖。比例尺,100 μm。免疫荧光图像代表至少3个类器官;定量PCR数据为8个合并类器官技术重复的平均值 ± 标准差。


3. 纤维化类器官中炎症反应和JAK/STAT相关信号发生变化

在确认TGF-β1能够诱导稳定的组织学改变后,研究人员进一步对TGF-β1处理组和对照组类器官开展RNA测序,分析纤维化过程中整体转录状态的变化


主成分分析显示,来自3次独立分化实验的样本能够按照处理条件明显分开,说明TGF-β1引起了较稳定的整体转录变化。与对照组相比,纤维化类器官中共有1968个基因显著上调,1628个基因显著下调。


基因集富集分析显示,TGF-β1处理后的类器官中,上皮-间质转化(EMT)、TGF-β信号、炎症反应、细胞周期调控和代谢相关通路均发生变化。炎症相关分析中,TNF-α/NF-κB信号和IL-6/JAK/STAT3信号明显富集。


这些结果说明,TGF-β1处理后的肾类器官不仅出现组织结构上的纤维化改变,也呈现与肾纤维化相关的整体转录变化,为后续定位关键调控通路和候选靶点提供了依据。

4.png

图3|模拟肾纤维化的肾类器官全转录组分析

A. 纤维化肾类器官(TGF)和对照类器官(CTR)的主成分分析。B. DESeq2 MA图,展示纤维化肾类器官与对照类器官相比的log2倍数变化。蓝色点表示校正后p值小于0.1;位于显示范围之外的数据点以向上或向下的空心三角形表示。C. 纤维化肾类器官与对照组之间的Hallmark基因集富集分析,展示特定生物状态或生物过程相关基因集变化。D. 基因集富集分析显示炎症相关通路明显富集。RNA测序样本于第26天收集,来自3次独立分化实验。


4. 阻断JAK/STAT信号可减少类器官中的纤维化表型

转录组分析显示,JAK/STAT信号在纤维化类器官中明显富集。研究人员随后进一步检验,抑制这一通路是否能够改变TGF-β1诱导的纤维化表型。


在JAK/STAT相关上调基因中,SOCS3、IL11、OSMR、LIF、JAK3、PIM1和STAT3等均出现升高。定量PCR进一步验证,TGF-β1处理后,类器官中的STAT3表达增加。


随后,研究人员在TGF-β1处理期间加入10μM托法替布,经联合处理后,STAT3表达下降;免疫荧光图像中,α-SMA⁺肌成纤维细胞减少,纤维化表型减弱。


该实验表明,JAK/STAT信号参与了TGF-β1诱导的人肾类器官纤维化过程。同时,该结果也说明这一类器官模型可用于验证与肾纤维化相关的通路干预策略。

5.png

图4|TGF-β介导的肾类器官纤维化过程中JAK/STAT信号发挥作用

A. 基因集富集分析显示JAK/STAT信号通路明显富集。B. 纤维化肾类器官中显著上调的JAK/STAT信号成员的log2倍数变化。C. 定量PCR分析显示,TGF-β1处理后第26天类器官中STAT3表达升高,并检测加入JAK/STAT抑制剂托法替布后的STAT3表达变化。D. 第26天对肌成纤维细胞(α-SMA)、足细胞(PODXL)、近端小管(LTL)和细胞核(DAPI)进行免疫荧光分析,显示托法替布处理后纤维化减少。比例尺,100 μm。免疫荧光图像代表至少3个类器官;定量PCR数据为8个合并类器官技术重复的平均值 ± 标准差。


5.PIM1在受损近端小管中升高,抑制PIM1减少纤维化改变

在JAK/STAT相关上调基因中,研究人员进一步关注丝氨酸/苏氨酸激酶PIM1。该分子在肺纤维化、狼疮性肾炎和肾缺血再灌注损伤中已有相关研究,但其是否参与肾纤维化过程仍缺少直接验证。


免疫荧光结果显示,TGF-β1处理后的类器官中,PIM1主要在LTL⁺近端小管细胞内升高,尤其集中于上皮结构受损、LTL染色部分缺失的区域。相比之下,CDH1⁺远端小管中未观察到明显的PIM1信号增加。


研究人员随后分析Nephroseq数据库中的肾组织表达数据。在53例CKD患者肾活检样本与8例对照样本的比较中,PIM1位于上调基因前3%,表达倍数变化为2.064。


在功能验证中,研究人员于纤维化诱导期间加入PIM1抑制剂AZD1208。处理后,类器官中的α-SMA⁺肌成纤维细胞减少,尤其是管周区域的纤维化表型减轻;LTL染色有所改善;定量PCR显示,ACTA2和COL1A1表达下降。


这部分实验将PIM1从转录组发现推进至细胞定位和药物干预验证,支持其作为肾纤维化候选研究靶点继续开展后续研究。

6.png

图5|PIM1作为肾纤维化候选介导分子和干预靶点的验证

A.第26天对PIM1、近端小管细胞(LTL)、远端小管细胞(CDH1)和细胞核(DAPI)进行免疫荧光分析,显示纤维化肾类器官近端小管细胞中特异性升高的PIM1,白色箭头所示。比例尺,10 μm。B. 使用Nephroseq数据库分析CKD患者肾组织基因表达数据。53例CKD患者肾活检与8例对照肾活检比较显示,PIM1位于上调基因前3%;Nakagawa CKD数据集,p < 0.001,倍数变化 = 2.064。C. 第26天对肌成纤维细胞(α-SMA)、近端小管(LTL)、足细胞(NPHS1)和细胞核(DAPI)进行免疫荧光分析,显示AZD1208处理后纤维化减少。比例尺,100 μm。D. 定量PCR分析显示,在肾类器官纤维化形成期间加入PIM1抑制剂AZD1208后,第26天促纤维化标志基因ACTA2和COL1A1表达下降。免疫荧光图像代表至少3个类器官;定量PCR数据为8个合并类器官技术重复的平均值 ± 标准差。



03 研究意义


本研究建立了一个以TGF-β1诱导的人肾类器官纤维化模型。该模型不仅出现肌成纤维细胞增加和胶原沉积,还保留了足细胞、近端小管、远端小管与间质成分之间的组织关系,因此能够同时观察肾单位受损与间质重塑。


研究人员利用这一模型完成了从表型建立、转录组分析到候选靶点干预验证的连续实验。JAK/STAT抑制可减少纤维化表型;PIM1在受损近端小管中升高,使用AZD1208抑制PIM1后,促纤维化相关改变减少。该研究为进一步分析近端小管损伤如何参与肾纤维化过程提供了人源实验依据。


但当前hiPSC来源肾类器官更接近发育期肾组织,缺乏完整集合管系统、功能性血管、过滤功能和免疫细胞成分;TGF-β1诱导模型主要适用于研究共同的促纤维化下游过程,不能覆盖不同CKD病因引起的全部病理变化。PIM1是否适合作为体内干预靶点,仍需在更复杂的人源模型和动物实验中进一步评价。


结语



肾纤维化研究需要一种既能保留人源肾组织结构,又便于进行机制分析和候选药物验证的实验模型。本研究利用hiPSC来源肾类器官,在TGF-β1刺激下建立了包含肾单位结构减少、肌成纤维细胞增加和间质胶原沉积的体外纤维化模型。

基于这一模型,研究人员通过RNA测序发现JAK/STAT信号异常,并进一步定位到PIM1在受损近端小管细胞中的升高。使用AZD1208抑制PIM1后,类器官中的肌成纤维细胞增加和促纤维化基因表达均有所下降。

这些结果说明,人肾类器官可用于研究肾纤维化相关机制,并支持候选干预靶点的早期评价。但从体外模型中的表型改善,到能够用于疾病治疗的干预策略,仍需要进一步完成体内有效性、安全性和适用范围验证。


关于晶莱


专注生物医药医学研发一站式服务平台.jpg

晶莱生物创立于2016年,拥有北京(北京晶莱华科生物技术有限公司)及长沙(湖南晶莱生物技术有限公司)两个研发机构,是专注于生物医药临床前研发与基础医学科研服务的国家高新技术企业及专精特新企业。依托北京、长沙两地的3000余平实验平台,晶莱构建了8个研究平台,可为客户提供包括临床前CRO、类器官模型构建、动物寄养、动物模型构建、细胞型构建、药效及各类表型、机制、通路等全方位的研究服务。


截至目前,晶莱生物已与国内超过1000家生物医药公司、高校及医院建立了紧密的合作关系,成功实施了10000余项研究/研发项目,积累了超过100000+客户。


尾图2.jpg