晶莱生物之circRNA研究思路

晶莱生物之circRNA研究思路：

环状RNA (circRNA) 是一类不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的一类特殊的非编码RNA分子，广泛存在于多种生物细胞中，具有结构稳定、序列保守及细胞或组织特异性表达等特点。

在功能上，circRNA富含miRNA结合位点，在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制，升高靶基因的表达水平；这一作用机制被称为竞争性内源RNA（ceRNA）机制。

circRNA也可以通过与RNA结合蛋白的结合来调控蛋白功能，还有少数circRNA可以编码多肽，通过该多肽行使调控功能。

circRNA与多种疾病密切相关，具有重要的研究价值，且稳定不易降解，所以其作为biomarker的研究是比较热门的。

circRNA与miRNA的相互作用关系是目前最常见的circRNA功能研究模式，研究思路可以概括为以下步骤：

1. 通过高通量测序和生信技术或circRNA芯片技术筛选出目标circRNA；

2. 验证 circRNA 的表达水平；

3. 通过网络数据库，预测 circRNA 可能结合的 miRNAs；

4. circRNA结合的miRNAs 的信息学筛选及荧光素酶进一步筛选验证；

5. miRNA 靶基因预测与功能富集分析；

6. miRNA 靶基因的筛选、 验证及相关功能研究；

7. circRNA-miRNA-mRNA调控网络的验证。