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晶莱生物之lncRNA研究套路

时间:2018-10-12 阅读:1474

晶莱生物之lncRNA研究套路:

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 nt的RNA分子。

研究表明,lncRNA可在表观遗产、转录、转录后等层面调控基因的表达,从而广泛参与各种生物学过程,lncRNA的异常表达与包括癌症在内的多种疾病密切相关。

随着高通量测序技术的发展,越来越多的lncRNA被鉴定出来,但具体的作用与功能仍然不是很清楚,因此lncRNA的研究领域依然是一片非常广阔的神秘区,具有极大的研究价值。

下面为大家简单介绍lncRNA研究的主要步骤:

1. lncRNA的筛选:常用的方法包括RNA-seq、lncRNA array等。通过这些高通量方法,研究人员可快速获得与特定生物学过程或者疾病相关的lncRNA。

2. lncRNA的验证:筛选到lncRNA后,可通过NONCODE或者lncRNAdb等网站进一步了解lncRNA的相关信息。在实验方面,可通过定量PCR或者Northern Blot验证lncRNA的表达;通过RACE技术获得lncRNA全长序列。对于lncRNA定位信息,可通过查询RNAlocate数据库或者相关分子实验确定。

3. lncRNA的功能研究:最基本的研究就是构建lncRNA表达载体或通过siRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA,直观地展现lncRNA的生物学功能。

在分子机制方面,常常通过lncRNA与RNA、lncRNA与蛋白、lncRNA与DNA等的相互作用分析来挖掘。

目前,lncRNA依然是科研领域的热点之一,筛选到特定生物学或疾病相关lncRNA是第一步,做好下游功能研究在很大程度上决定文章的高度。


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