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【五分钟讲实验】96孔板类器官药敏实验 Protocol:从铺板、加药到结果分析

时间:2026-06-26 阅读:106
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类器官药敏实验是肿瘤类器官研究中常用的体外药物反应评估方法。相比单纯观察形态变化,标准化的 96 孔板药敏实验可以结合药物浓度梯度、复孔设计和定量读数,更系统地比较不同处理条件下类器官的反应差异。


本文以“已建立、可稳定传代的肿瘤类器官”为前提,梳理一套适用于 96 孔板体系的常见药敏实验流程,重点覆盖类器官悬液准备、铺板、药物处理、终点检测和数据分析几个关键环节。



一、实验适用前提


本流程适用于已经完成建系、能够稳定传代的肿瘤类器官,用于体外药物反应评估。

若类器官处于初建系阶段,或存在明显污染、坏死、形态差异过大等情况,不建议直接进入药敏实验。


实验前应尽量保证:

1. 类器官处于稳定生长期;

2. 同一批实验使用相近传代数的样本;

3. 类器官大小相对均一;

4. 铺板前活率较高;

5. 不同处理组的接种密度保持一致。


其中,接种密度、基质胶体积、药物浓度梯度和终点检测时间,是影响药敏结果稳定性的核心因素。



二、Day -1:准备类器官悬液


加药前一天,需要将类器官从原培养体系中回收,并制备成适合铺板的小团块或细胞团悬液。


1. 去除旧培养基

吸去原培养孔中的旧培养基,操作时尽量避免直接吸走基质胶中的类器官;

若类器官嵌在基质胶中,可使用冷的基础培养基或类器官回收液帮助基质胶松散。


2. 回收类器官

加入适量冷的基础培养基或类器官回收液后,轻柔吹打,使基质胶与类器官充分分散。

吹打时动作应保持一致,避免剧烈操作造成类器官过度破碎;随后将悬液转移至离心管中。


3. 离心收集可参考以下条件:

· 300–400 g;

· 4℃;

· 3–5 min。


离心后弃去上清,保留类器官沉淀。


4. 消化与打散

根据类器官大小和紧密程度,加入适当消化液处理 5–10 min。

处理期间可间断轻柔吹打,使类器官变成较小团块或细胞团。

此步骤的目标不是完全消化成单细胞,而是获得大小相对均一、适合后续铺板的类器官片段。


5. 建议铺板前状态:

· 类器官团块大小尽量控制在 40–100 μm;

· 细胞活率建议 ≥80%;

· 同一批实验尽量保持相同处理方式。


消化结束后,加入培养基终止反应,再次离心收集类器官,并重悬计数。



三、Day -1:96孔板铺板


药敏实验推荐使用白色不透明 96 孔板,便于后续进行发光法细胞活性检测。

若后续需要进行明场或荧光成像,也可根据检测设备选择透明底或成像兼容孔板。


1. 接种量设置,可参考以下起始条件:

· 每孔接种 3,000–5,000 个活细胞;

· 或每孔接种 50–100 个小类器官团块;

· 每孔基质胶体积 5–10 μL。

具体接种量需根据类器官生长速度、药物处理周期和检测灵敏度进行预实验优化。


2. 基质胶点胶

将类器官悬液与基质胶充分混匀后,按设定体积点入 96 孔板中。点胶时需注意:

(1)每孔胶滴体积保持一致;

(2)避免产生气泡;

(3)胶滴位置尽量居中;

(4)操作过程尽量保持低温,减少基质胶提前凝固。

点胶完成后,将孔板置于 37℃孵育 10–15 min,使胶滴充分凝固。


3. 加入培养基

胶滴凝固后,每孔加入 80–100 μL 完全培养基,加液时沿孔壁缓慢加入,避免直接冲击胶滴。

边缘孔容易出现蒸发效应,可根据实验设计选择加入 PBS 或不作为正式检测孔使用。

铺板后,将孔板置于培养箱中恢复培养 12–24 h,再进行药物处理。



四、Day 0:药物处理与分组设计


铺板恢复 12–24 h 后,可开始药物处理,在药敏实验中,分组设计直接影响后续数据是否具有解释性。


1. 基础分组建议至少设置以下几类孔:

(1)空白孔:无细胞,仅含基质胶和培养基,用于背景校正。

(2)溶剂对照孔:加入与实验组相同终浓度的溶剂,例如 DMSO。DMSO 终浓度建议控制在 ≤0.1%。

(3)阳性对照孔:选择体系中已知可产生反应的药物,用于确认检测体系是否正常。

(4)实验组:加入待测药物,并设置多个浓度梯度。


2. 药物浓度设计

为获得剂量反应关系,通常需要设置 8–10 个浓度梯度,常见设计方式包括:

· 1:3 梯度稀释;

· 1:5 梯度稀释;

· 从 10 μM 等起始浓度向下连续稀释。

起始浓度应根据药物性质、文献基础和预实验结果确定。每个浓度建议设置不少于 3 个复孔。


3. 加药操作

加药时轻轻吸走部分旧培养基,避免碰到胶滴;随后加入等体积含药培养基,使各孔最终体积保持一致。

所有孔应尽量在同一时间窗口内完成加药,并记录加药时间,后续检测时间也应以该时间点为基准统一计算。



五、Day 3–5:终点检测


多数类器官药敏实验可在加药后 72 h 进行终点检测。

若类器官生长较慢,或药物作用较缓慢,也可延长至 5 天,但同一批实验的检测时间必须保持一致。


1. 明场成像

检测前可先进行明场拍照,记录类器官形态变化,包括:

(1)类器官数量;

(2)大小变化;

(3)边缘完整性;

(4)结构崩解情况;

(5)是否出现明显碎片或坏死样改变。

明场成像可以帮助解释活性读数,但不建议只依赖形态观察作为最终判断依据。


2. 细胞活性检测

可采用 3D 细胞活性发光法进行定量检测,参考流程如下:

(1)检测前将试剂和孔板平衡至室温;

(2)每孔加入与培养基等体积的 3D 活性检测试剂;

(3)振荡裂解 5 min;

(4)室温避光孵育 20–30 min;

(5)读取发光值。

若类器官包埋在基质胶中,应确保裂解充分,否则可能影响读数稳定性。


3. 补充验证

根据实验目的,可进一步进行 IF、IHC、qPCR 或其他分子检测,用于观察增殖、凋亡或相关通路变化。

如果药敏实验用于机制研究,建议不要只停留在活性读数,而应结合标志物检测或通路分析。

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图:患者来源肿瘤类器官药物筛选结果示例



六、数据计算与结果分析


1.细胞活性百分比可按以下公式计算:

活性% =(药物孔读数 - 空白孔读数)/(溶剂对照孔读数 - 空白孔读数)×100%

完成数据归一化后,可进一步绘制剂量反应曲线,并计算 IC50 或 AUC。


2.质控建议:

(1)溶剂对照孔 CV 尽量控制在 20%以内;

(2)空白孔背景不宜过高;

(3)同一浓度复孔差异过大时,应回看铺板密度、胶滴体积和加药操作;

(4)若边缘孔波动明显,应考虑蒸发效应;

(5)若整体信号偏低,应检查类器官状态、铺板量和试剂裂解效率。



七、常见影响因素


类器官药敏实验中,以下细节最容易影响结果:

1. 每孔初始细胞数不一致;

2. 类器官团块大小差异过大;

3. 基质胶体积不统一;

4. DMSO 终浓度不一致;

5. 加药后培养时间不一致;

6. 边缘孔蒸发未控制;

7. 只设置单一浓度,无法分析剂量反应;

8. 只看形态变化,缺少定量读数;

9. 复孔数量不足;

10. 不同传代数样本混用于同一批实验。



八、结语


96孔板类器官药敏实验从类器官悬液准备、接种密度、基质胶体积,到药物浓度梯度、复孔设置、检测时间和数据归一化,每一步都会影响最终读数。


对于药物筛选或体外药物反应评估来说,建议在正式实验前先完成小规模预实验,确定合适的接种量、检测时间和药物浓度范围,再进入正式药敏检测。


注:涉及人源样本的研究需符合伦理审批和生物安全要求。本文参数仅作为常见起始条件参考,具体实验方案应根据类器官来源、药物性质、培养体系和研究目的进行优化。


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