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患者来源类器官的通用实验操作流程参考!

时间:2026-05-28 阅读:114
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本文介绍了建立患者来源类器官的通用实验方案,该方案可应用于多种上皮组织。



原代人体组织的收集与类器官培养制备



注意:涉及原代人体组织材料的研究必须遵守所有相关机构和政府法规。所有受试者在收集原代人体组织材料前必须签署知情同意书。


1.组织取材收集

①按活检部位和/或组织类型(即正常组织和肿瘤组织)分开,将原代人体组织碎片收集于50ml锥形管中,加入45ml冰浴的adDMEM/F12+++培养基。(可选)向adDMEM/F12+++培养基中添加10μMROCK抑制剂以提高细胞存活率。将组织样本置于该培养基中,4℃保存直至开始分离。

②根据原代组织来源的不同,组织碎片可在4℃保存长达72小时,且类器官生长效率无显著损失,但理想情况下应尽快进行后续步骤。

③评估所获组织碎片是否仅含上皮组织,或是否还含有脂肪或肌肉组织。若含有非上皮成分,在解剖显微镜下使用手术剪或手术刀和镊子尽可能去除。若无非上皮成分,立即进行下一步。


2.关键步骤:非上皮材料可能会减慢单细胞消化速度,或导致对具有类器官形成能力的(上皮)细胞数量的高估。

①在10cm细胞培养皿中,使用手术剪或手术刀将组织切碎为1-3mm³的小碎片。

②取1-2块代表性碎片固定于固定液(即10%(质量体积比)福尔马林或4%(质量体积比)多聚甲醛)中,用于组织学分析。

③取部分碎片速冻于-80℃,用于分子生物学(即全外显子组/基因组测序或mRNA测序)或生物化学(即蛋白质免疫印迹或蛋白质组学)分析。这些碎片也可用于分离DNA,通过SNP/STR指纹图谱进行质量控制/验证患者来源。



原代组织类器官的建立



①根据肿瘤类型对所得组织进行适当消化。密切监测消化过程,对于孵育时间<2小时的样本,每10-15分钟剧烈摇晃并使用P1000移液器上下吹打混合物以混匀。对于过夜孵育的样本,将混合物置于摇床上。消化过程中添加10μMROCK抑制剂可提高生长效率。对于头颈部类器官,消化时间不应超过1小时,并需定期监测。

关键提示:密切监测消化过程,过度消化会显著降低生长效率。一般来说,当观察到由2-10个细胞组成的细胞团混合物时,消化即完成。当开始培养一种新的组织类型时,建议在消化过程中取少量消化物进行接种,以确定该特定组织的最佳平均消化时间。


②当混合物变浑浊且剩余组织碎片被破碎后,用P1000移液器上下吹打10-20次进一步辅助组织破碎。加入10mladDMEM/F12+++培养基洗涤一次,4℃、200g离心5分钟。

③将沉淀重悬于10mladDMEM/F12+++培养基中,用100μm细胞筛过滤。

④将重悬并过滤后的细胞悬液4℃、200g离心5分钟。

⑤吸去上清,将沉淀重悬于BME或基质胶中。BME需置于冰上以防止凝固,因此操作要迅速。BME的用量取决于沉淀的大小,约每10000个细胞接种于40μlBME中。

关键提示:不要过度稀释BME(BME体积分数应>70%),以确保形成坚实的液滴。


⑥将含类器官的BME以每滴约10μl的体积接种于预热的24孔悬浮细胞培养板底部,每孔接种3-4滴。

关键提示:

类器官重悬于BME后,应尽快进行接种,因为BME可能会在试管或移液器吸头中凝固。

培养板应提前置于37℃湿润培养箱中过夜预热。若预热不充分,BME液滴会在培养板表面立即变平,类器官更容易贴附于培养板底部。

不要直接将培养基加在BME液滴上方,以免破坏液滴。


⑦将培养板置于37℃、5%(体积分数)CO₂的湿润培养箱中培养。

⑧每2-3天小心吸去孔中的培养基,更换为新鲜的预热培养基。在培养物的前两次传代中,培养基中需保留ROCK抑制剂和Primocin(头颈部类器官还需保留卡泊芬净)。

关键提示:

BME液滴可能会从悬浮板上脱落并在培养基中“漂浮”。在这种情况下,建议不使用基于TrypLE的类器官解离方法,直接重新接种类器官。密切监测类器官的形成情况。理想情况下,首次传代应在初始接种后12-14天进行。

不要过早进行传代,否则可能导致培养失败。

在最初的传代中,确保培养物的最佳密度(一般经验法则为每40μl接种10000个细胞),即使这意味着需要重新接种材料以减少孔数。



类器官的传代



①上下吹打以破碎BME或基质胶,将类器官悬液转移至15ml锥形管中。

②加入10ml冰浴的adDMEM/F12+++培养基至满管,以辅助去除BME。

③4℃、200g离心5分钟收集类器官。

④吸去上清,根据类器官类型选择传代方法:使用TrypLE(适用于头颈部以及致密的乳腺、结肠、胰腺和肝脏类器官)或机械破碎(适用于卵巢以及囊性的乳腺、结肠、胰腺和肝脏类器官)。

TrypLE细胞解离法:将沉淀重悬于1mlTrypLE中,上下吹打,37℃孵育直至类器官解体。每3-5分钟用套有P10吸头(无滤芯)的P1000滤芯吸头上下吹打≥10次,辅助破碎类器官。密切监测消化过程,尽量缩短TrypLE的孵育时间。

机械破碎法:将沉淀重悬于3mladDMEM/F12+++培养基中。用套有P10吸头(无滤芯)的P1000滤芯吸头上下吹打类器官悬液30次。利用管底产生的压力辅助破碎类器官。

关键提示:TrypLE解离时间不要超过15分钟,否则会导致类器官生长不良甚至培养失败。一般来说,当观察到由2-10个细胞组成的小细胞团混合物时,消化即完成。

关键提示:若为药物筛选做准备,消化不完全导致的大细胞团或完整类器官碎片,会在制备药物筛选用类器官悬液时被过滤掉,从而导致类器官产量降低。

⑤破碎完成后,加入10mladDMEM/F12+++培养基洗涤。

⑥将类器官沉淀重悬于70%(体积分数)BME中,按照步骤10-13所述方法,以小液滴形式接种于预热的培养板底部。接种完成后,翻转培养板,置于37℃、5%(体积分数)CO₂的湿润培养箱中30-60分钟。

⑦将含10μMROCK抑制剂的类器官培养基预热至37℃。

⑧BME液滴凝固后(30-60分钟),小心地将预热的培养基加入孔中。

关键提示:不要直接将培养基加在BME液滴上方,以免破坏液滴。

⑨将培养板置于37℃、5%(体积分数)CO₂的湿润培养箱中培养,直至需要用于药物筛选。



类器官的冻存


关键提示:药物筛选前无需冻存类器官,可直接用显微镜检查类器官,评估培养物质量,排除培养物污染的可能性后,再开始制备类器官。

传代后2-3天,吸去培养基,向每孔加入500μladDMEM/F12+++培养基。用P1000滤芯吸头破碎BME液滴,将材料转移至冰浴的15ml锥形管中。

关键提示:为确保通过洗涤完全去除BME,一个15ml锥形管最多可合并12孔24孔细胞培养板的类器官。若使用更多材料,每个培养物需使用多个试管,后续制备筛选用类器官悬液时可再合并。(可选)若冻存更多孔或多个细胞培养板,相应调整15ml锥形管的数量。


②(可选)若BME含量较高,向装有类器官的15ml锥形管中加入adDMEM/F12+++培养基至总体积12ml,用预润(用adDMEM/F12+++润洗)的10ml血清移液管上下吹打,将试管置于冰上10分钟。再次用10ml血清移液管上下吹打数次。样本在冰上放置时间越长,BME溶解越充分。

③4℃、200g离心5分钟收集类器官。

④小心吸去上清,不要扰动沉淀。

⑤(可选)若一个类器官培养物使用了多个15ml锥形管收集,将每个试管的沉淀重悬于1mladDMEM/F12+++培养基中,全部转移至一个15ml锥形管中。再次4℃、200g离心5分钟,小心吸去上清,不要扰动沉淀。

⑥加入所需体积的无细胞冻存培养基,用P1000移液器上下吹打充分重悬类器官。

关键提示:每4个24孔细胞培养板的“原始”孔类器官使用500μl冻存培养基。


⑦每个无菌冻存管加入500μl含重悬类器官的冻存培养基。

⑧将冻存管放入冻存盒中,置于-80℃保存。

⑨-80℃保存24小时后,将冻存管从冻存盒中取出,转移至液氮罐中(约-180℃)。



冻存类器官的复苏



从液氮罐中取出装有冻存类器官的冻存管,置于干冰上运输。

②每个待复苏的冻存管准备一个15ml锥形管,加入10ml室温的adDMEM/F12+++培养基。

③将冻存管置于37℃水浴中孵育1-3分钟,融化含类器官的冻存培养基。

关键提示:密切监测融化过程,一旦冻存培养基完全融化,立即从水浴中取出冻存管。考虑到走到生物安全柜所需的时间,可在仍有一小块冰残留时取出。


④向冻存管中逐滴加入1mladDMEM/F12+++培养基并混匀,然后将管中全部内容物转移至15ml锥形管中。加入adDMEM/F12+++培养基至总体积10ml。

⑤4℃、200g离心5分钟收集类器官。

⑥小心吸去上清,不要扰动沉淀。

⑦再进行以下操作:

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关键提示:若洗涤过程中冻存培养基的稀释倍数未达到至少10倍,应额外进行一次洗涤步骤,以确保在接种前充分稀释冻存培养基。



故障排除


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