晶莱生物之circRNA数据库

      环状RNA（circRNA）是一类特殊的非编码RNA分子（在活体中有时也有表达），也是RNA领域的研究热点。与传统的线性RNA（linear RNA，含5’和3’末端）不同，circRNA分子呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。

       在功能上，近年的研究表明，circRNA分子富含microRNA（miRNA）结合位点，在细胞中起到miRNA海绵（ miRNA sponge）的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平；这一作用机制被称为竞争性内源RNA（ceRNA）机制。

       通过与疾病关联的miRNA相互作用， circRNA在疾病中发挥着重要的调控作用。科研人员目前可以从circbank数据库进行检索分析，数据库目前整合了人类全基因组140790条circRNA相关信息，提供友好检索界面，主要提供以下7种功能：

       ▶ 为circRNA提供标准化命名体系（140790条人类circRNA）；

       ▶  提供circRNA-miRNA结合位点预测结果；

       ▶  circRNA跨物种保守性分析（人与小鼠）；

       ▶  circRNA的M6A修饰相关数据；

       ▶  circRNA突变位点注释（关联了cosmic突变数据）；

       ▶   circRNA蛋白编码潜能和IRES位点预测；

       ▶  提供circRNA的UCSC基因组trackhub（实现全基因组circRNA数据可视化）