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【五分钟讲实验】这些WB实验案例中的问题你遇到过吗?

时间:2023-10-16 阅读:298

往期我们介绍了蛋白质免疫印迹(Western Blot)相关实验结果分析知识点及实验操作。


往期回顾一:影响WB实验结果的因素综述

往期回顾二:聊一聊WB的一些事

往期回顾三:蛋白质免疫印迹(Western Blot,WB )实验操作


今天小编根据实验案例跟大家更加细致的讲解WB实验会出现的问题及解决方法。




案例分析


1. 案例一

难点:内参一直跑不齐

解决过程:①根据灰度值计算进行多次内参调整;②重新制样;③更改上样量;④用指标膜再生内参 。依旧不齐。

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原因分析:细胞样本不同,与抗体反应能力不同,因此内参会产生这种特殊情况,想要跑齐内参上样量将会差非常多,后续分析对应相应的内参即可。

总结反思:内参多次不齐后,思考是否是样本问题,找准原因,注意是否样本本身内参就无法跑齐,不要一味地浪费大量时间精力还有资源。



2. 案例二

难点:LC3B I/II(abcam ab48394)指标出现拥挤反白现象。

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解决过程:经过重复实验,多次操作,讨论出现这种情况的几个原因:小分子指标(17,19KD)减少了电泳时间,电泳时间过短条带未跑开;样本有问题;电泳过程漏液。排除了这些问原因后问题依旧出现,增加了洗膜时间后曝光,这种现象消失。

总结反思:小分子指标曝光较难,曝光前可多洗洗,隔段时间曝光一次;注意控制电泳时间,防止小分子指标弥散。



3. 案例三

难点:小分子指标(11、13KDa),条带曝光不出来,或者效果不好。

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解决过程:先后进行了减少电泳时间、更换0.22um的膜、增加洗膜时间等方法,效果依旧不理想,开始尝试配制18%浓度的胶,并进行冰水浴电泳防止小分子指标跑散。

总结反思:针对这么小的小分子指标,经验已经无法解决问题,需要我们进行尝试和摸索,根据具体案例具体调整分析,例如冰水浴电泳、更高浓度的胶。




经验总结


问题1:配胶时,经常出现气泡或者絮状物杂质,还会出现脱胶问题

解决方法:

①采用保鲜膜包裹底座防止气泡产生;

②及时更换吸水纸;加琼脂少量快速,不要碰到梳子;

③不同的胶凝固时间根据温度条件灵活把控,比如15%或者18%的胶凝固快,可以缩短凝固时间到24min左右,或者减少TEMD的量;

④倒浓缩胶前晒干过程尽量不要倒扣,冰箱里保存时容器里放一些水。


问题2:曝光时,有时膜上杂质过多,小分子指标出现拥挤条反白条带

解决方法:

①目的条带充分跑开,小分子指标不要跑丢,小分子指标可适当缩短电泳时间,大分子量增加电泳时间;

②膜上较脏或者看不到目的条带的可增加曝光前TBST洗膜时间,尤其是小分子指标;

③封闭液摇匀,冰箱放置后使用上层液体,防止沉淀中杂志附着在膜上;

④磷酸化指标改用5%BSA封闭过夜。


问题3:电泳时漏样

解决方法:

①配胶要混均匀,玻璃板无杂质;

②加浓缩胶前放置时间久一点,确保无水乙醇充分挥发;

③提取蛋白时,离心后只吸上清,一定不要有沉淀,蛋白变性前再离心一次,以保证样本无干扰;

④组织样本上样前离心时间在半分钟以上,有效减少漏样问题。





关于晶莱


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晶莱生物(GENELINE Co., Ltd)创立于2016年,拥有北京(北京晶莱华科生物技术有限公司)及长沙(湖南晶莱生物技术有限公司)两个研发机构,是专注于生物医药临床期前研发与基础医学科研服务的高新技术企业。依托北京、长沙两地的3000余平实验平台,晶莱构建了8个研究平台,能提供动物寄养、动物模型构建、细胞模型构建,药效研究,各类表型、机制、通路等研究服务。

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