RAP

实验意义

探究转录后水平RNA与蛋白质的相互作用，以及转录后调控网络的动态变化，可了解恶性肿瘤以及遗传学疾病等转录后调控网络的动态变化，应用于病理诊断和科学研究工作等。

实验原理及流程

RNA反义纯化（RNA Antisense Purification, RAP）设计一段与目标RNA互补的寡核苷酸探针，并对其进行生物素标记，使用该探针将目标RNA拉下来，同时与目标RNA相互作用的蛋白也被捕获，然后经链霉亲和素标记的磁珠纯化，通过Real Time RT-PCR、WB、二代测序或质谱进行进一步的鉴定。实验流程为探针设计→待测样品准备（细胞、组织或待测RNA和蛋白质等）→生物素标记探针与RNA杂交→RAP→分离RNA和蛋白质进行鉴定分析。

结果展示^[1]

实验周期及交付标准

1. 实验周期：1-3个月

2. 交付标准：RAP鉴定结果报告、分析报告、实验报告（试剂、耗材、实验步骤）、原始数据等

需确认的信息

1. 目的基因及种属以及ID号。

2. 目的基因序列

3. 样本数量及分析要求

参考文献

[1] Engreitz J , Sirokman K , Mcdonel P , et al. RNA-RNA Interactions Enable Specific Targeting of Noncoding RNAs to Nascent Pre-mRNAs and Chromatin Sites[J]. Cell, 2014, 159(1):188-199.

[2] Engreitz J , Lander E S , Guttman M . RNA Antisense Purification (RAP) for Mapping RNA Interactions with Chromatin[J]. Methods Mol Biol, 2015, 1262(1262):183-197.

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